Lenka Wimmerová se zabývá různými aspekty oblasti ochrany životního prostředí více než 25 let. V průběhu své praxe pracovala v několika komerčních společnostech (např. Dekonta a.s., Aquatest a.s., ALS Laboratory Group Norway AS), a spolupracovala s řadou výzkumných a grantových organizací i státních institucí (ÚCHP AV ČR v.v.i., TAČR, Direktorate-General for Environment, EC, Magistrát hl. města Prahy aj.). Od roku 2016 pracuje na Fakultě životního prostředí ČZU v Praze, v Ústavu aplikované ekologie, nejprve jako odborný asistent, od roku 2023 zastává pozici docenta. V rámci své činnosti se zabývá výzkumem v oblasti testování toxicity vodního a terestrického prostředí, detekce mikroplastů a biodegradability vybraných, zejména plastových a jednorázových materiálů. Současně se intenzivně věnuje moderním nástrojům hodnocení dopadů lidských aktivit na životní prostředí, jako je modelování životního cyklu (LCA), vyčíslení environmentálních stop (uhlíkové, vodní, ekologické), hodnocení zelených a nových či inovačních technologií pro životní prostředí (hodnocení ETV a eTEA) a aplikace postupů environmentálního managementu (dle standardů ISO, EN a ČSN). Velký důraz klade na prevenci, omezení greenwashingu a podporu environmentálního vzdělávání vybraných cílových skupin. Od roku 2018 spolupracuje se společností Beatworx s.r.o. na environmentální kampani Rollin‘ Green festivalu Let it Roll. Od roku 2020 se díky získání státní podpory z programu ÉTA, TAČR, věnuje se svým týmem, studenty a kolegy z Centra pro otázky životního prostředí, UK, společností Augiášův chlév s.r.o. a Beatwork s.r.o., studiu pro-environmentálního chování účastníků open-air letních festivalů v ČR a spolupracuje s festivalovou asociací FESTAS.